Smertene som forårsakes av lupus har ulike årsaker. Ved lupus oppstår det ofte leddsmerter (artralgi eller artritt) og muskelsmerter (myalgi eller myositt). Disse ledd- og muskelsmertene er betennelsesbetingede, og i de fleste tilfeller lindres de svært godt av betennelsesdempende eller til og med immunmodulerende behandling. Det er også mulig å få brystsmerter som forsterkes ved innpust: De tilsvarer betennelse i hjerteposen eller lungehinnen som omslutter henholdsvis hjertet og lungene; disse smertene blir mindre ved riktig behandling.

Smertene kan være diffuse og plagsomme, uten sammenheng med betennelse, noe som kan gi mistanke om fibromyalgi assosiert med lupus.

Noen ganger klager pasientene over mer diffuse smerter, med inntrykk av at "alt gjør vondt". Disse smertene er ofte forbundet med stor tretthet og vansker med å klare daglige gjøremål, og noen ganger med andre symptomer, som konsentrasjons- og hukommelsesproblemer.

Når vi står overfor denne typen manifestasjoner, må vi først forsikre oss om at det ikke foreligger noen lupusrelatert betennelse. I fravær av noen anomali, er det da nødvendig å vurdere en "forstyrrelse" av hjernens kontroll av smerte. Denne lidelsen kalles ofte "fibromyalgi". Fibromyalgi assosiert med lupus medfører ingen spesiell risiko for skade eller ødeleggelse av et organ, men smertene som pasienten faktisk føler, er spesielt plagsomme på grunn av deres langvarige natur og den begrensede effekten av smertestillende medisiner. Det er viktig å berolige pasienten og ikke øke behandlingen med kortison eller immunsuppressiva mot denne typen smerter, da de vil være ineffektive. Bruk av medikamenter som ellers er forskrevet ved depresjon eller epilepsi, kan imidlertid ha en nyttig smertelindrende effekt. Noen ganger kan det også være nyttig med hjelp fra psykolog og psykiater, i tillegg til fysisk behandling.

Noen ganger kan diffuse smerter ha sammenheng med at man slutter for brått med kortison. Når kroppen har blitt "vant" til å ta kortison, går binyrene (som normalt produserer kortison for kroppen vår) til hvile. Dermed vil brått opphør (som absolutt må unngås) av ethvert inntak av kortikosteroider føre til smerter (spesielt muskelsmerter, noen ganger i magen) og stor tretthet, fordi kroppen ikke har klart å gjenoppta produksjonen av "endogent" kortison raskt nok. Legen din vil kunne stille diagnosen raskt og vil raskt foreslå å ta en tilstrekkelig dose kortison.

Ved "godartet" gastroenteritt, hvis du ikke holder nede kortison oralt, må det absolutt gis i injiserbar form i en dag eller to. Det samme gjelder ved operasjoner som krever at du er fastende.