Lupuksen aiheuttamalla kivulla on useita syitä. Lupuksessa esiintyy usein nivelkipua (nivelkipu eli artralgia tai niveltulehdus eli artriitti) ja lihaskipua (lihaskipu eli myalgia tai lihastulehdus eli myosiitti). Nämä nivel- ja lihassäryt ovat tulehduksellisia, ja useimmissa tapauksissa ne lievittyvät hyvin tulehduskipulääkkeillä tai joissain tapauksissa biologisilla ja immunosupressiivisilla lääkkeillä. Rintakivut, jotka lisääntyvät sisäänhengityksen yhteydessä: ne voivat johtua sydänpussin tai keuhkopussin tulehduksesta; nämä kivut lievittyvät asianmukaisella hoidolla.
Kipu voi olla hajanaista ja ahdistavaa, eikä se liity tulehdukseen, jolloin voidaan olettaa, että kyseessä on lupukseen liittyvä fibromyalgia.
Joskus potilaat valittavat hajanaisemmasta kivusta, jolloin tuntuu, että "kaikki tekee kipeää". Näihin kipuihin liittyy usein suurta väsymystä ja vaikeuksia selviytyä päivittäisistä tehtävistä, joskus on myös muita oireita, kuten keskittymis- ja muistihäiriöitä.
Kun kyseessä on tämäntyyppinen ilmenemismuoto, meidän on ensin varmistettava, ettei kyseessä ole lupukseen liittyvää tulehdusta. Jos mitään poikkeavaa ei esiinny, voi kyseessä olla aivojen kivunhallinnan "häiriö". Tätä häiriötä kutsutaan usein nimellä "fibromyalgia". Lupukseen liittyvä fibromyalgia ei vaurioita tai tuhoa elimiä, mutta potilaan tosiasiallisesti tuntemat kivut ovat erityisen ahdistavia niiden pitkäaikaisen luonteen ja kipulääkkeiden rajallisen tehon vuoksi. On tärkeää luottaa tähän tietoon eikä lisätä kortisonihoitoa tai immunosuppressiivisia lääkkeitä tämäntyyppisiin kipuihin, koska ne ovat fibromyalgiaan tehottomia. Masennukseen tai epilepsiaan muuten määrättyjen lääkkeiden käytöllä voi kuitenkin olla hyödyllinen kipua lievittävä vaikutus. Myös psykologin ja psykiatrin avusta on joskus hyötyä, samoin kuin fysioterapiasta.
Joskus hajanainen kipu voi liittyä kortisonin liian äkilliseen lopettamiseen. Kun elimistö on "tottunut" kortisonin ottamiseen, lisämunuaiset (jotka normaalisti tuottavat kortisonia elimistöllemme) menevät lepotilaan. Näin ollen kortikosteroidien saannin äkillinen lopettaminen (jota on ehdottomasti vältettävä) aiheuttaa kipua (erityisesti lihaskipua, joskus vatsassa) ja suurta väsymystä, koska elimistö ei ole kyennyt käynnistämään "sisäsyntyisen eli endogeenisen" kortisonin tuotantoa riittävän nopeasti. Lääkäri pystyy tekemään diagnoosin nopeasti ja ehdottaa kiireellisesti riittävän kortisoniannoksen ottamista.
Kun kyseessä on "hyvänlaatuinen" maha-suolikanavan tulehdus, jos et saa pidettyä kortisonia suun kautta, se on ehdottomasti annettava injektiona päivän tai kahden ajan. Sama pätee, jos leikkaus edellyttää paastoa.
Lupuksen kivut voivat liittyä tulehdusreaktioon, joka paranee taudin hoidon myötä. On kuitenkin olemassa hajanaisia kipuja, jotka voivat olla seurausta fibromyalgiasta eli kivunhallinnan häiriöstä. Näitä fibromyalgian kipuja on vaikeampi lievittää, mutta ne eivät todennäköisesti vahingoita niveliä tai lihaksia.