Oplodnění in vitro je často doprovázeno hormonální léčbou, která může "aktivovat" lupus a může být důvodem dočasného posílení léčby. V případě hormonální léčby je třeba dávat obzvlášť pozor na riziko vzniku krevní sraženiny (flebitidy) u pacientů, kteří mají APS. Je nezbytné, aby tento postup probíhal za pečlivého lékařského sledování a zvláště přizpůsobené léčby.