La pèrdua de cabell (en termes mèdics, "alopècia"), que normalment es propaga per tot el cuir cabellut, de vegades acompanya l'activitat del lupus. Remet sense seqüeles amb el tractament general de la malaltia. Però el creixement és lent... D'altra banda, quan el lupus discoide presenta plaques localitzades d'alopècia, la garantia que el cabell torni a créixer és incerta. Si la pèrdua de cabell es produeix fora d'un brot de lupus, caldria cercar una altra causa. Això pot ser secundari a un fàrmac (immunosupressor), deficiència de ferro o vitamina, anormalitat tiroidal, excés de testosterona (hiperandrogenisme), una situació estressant o, de vegades, hàbits de perruqueria (cabell trenat que produeix alopècia per tracció).
Finalment, es comú l’increment de la pèrdua de cabell en totes les dones en el primer semestre després del part. Per tant, durant aquest període, aquesta pèrdua no es considera un sinònim d'activitat del lupus.
El lupus sistèmic va acompanyat d’una pèrdua de cabell difusa que s'esvaeix quan el brot ha remès completament. Si la pèrdua de cabell ocorre fora d'un brot de lupus, llavors caldria cercar-ne una altra causa.