Poques vegades està directament relacionat amb l'activitat de la malaltia. No obstant això, els pacients amb lupus sovint es queixen de mal de cap. Moltes vegades, són mals de cap anomenats "tensionals" causats per l'estrès i no directament relacionats amb el lupus (si no és que l'estrès es pugui relacionar amb una malaltia crònica).

De vegades, es tracta de migranyes que són unilaterals i que, sovint, estan acompanyades d’alteracions visuals o sinusitis no relacionada amb el lupus. Rarament, els mals de cap poden ser indicatius d'una complicació específicament relacionada amb el lupus, com un vessament cerebral o una pressió arterial alta. En aquests casos, els mals de cap resisteixen (o són resistents) als tractaments habituals per al dolor, persisteixen durant diversos dies i sovint s'acompanyen d'altres símptomes. És necessari consultar ràpidament el vostre metge que, després d'una exploració clínica detallada, avaluï la necessitat de realitzar proves neurològiques addicionals (TAC o RMN cerebral).