En forskningsprotokoll er en studie som har som mål å øke kunnskapen om forekomst, mekanismer og behandling av en sykdom.

Det skilles mellom grunnforskningsprotokoller, som har som mål å forbedre forståelsen av sykdommens årsaker, og kliniske og terapeutiske forskningsprotokoller, som har som mål å forstå sykdommen bedre og teste nye behandlinger eller terapeutiske strategier sammenlignet med en referansebehandling eller placebo.

Inkludering i en av disse protokollene kan bare skje etter at pasienten har lest et informasjonsark og signert et informert samtykke. Gjennomføringen av en forskningsprotokoll krever at man finner en sponsor, innhenter samtykke fra en rådgivende komité for beskyttelse av personer og skaffer finansiering til gjennomføring og praktisk utførelse av studien.

Det blir stadig flere forskningsprotokoller innen systemisk lupus. Disse er ofte europeiske eller internasjonale protokoller. I løpet av de siste 15 årene har de ført til mange fremskritt i behandlingen og kunnskap om nye terapeutiske mål. For tiden knyttes det store forhåpninger til nye immunmodulerende legemidler som er under evaluering.