Prednizon se može primenjivati oralno (per os) u obliku tableta, intramuskularnim ili intravenskim injekcijama (direktno ili infuzijom), lokalno kroz infiltraciju zgloba, ili na kraju primenom direktno na kožu (perkutano) u vezi sa zglobom (gel, krema ...) ili na određene osipe izazvane lupusom.

Uobičajeni način primene ostaje oralna ruta, u obliku tableta. Lek koji preporučujemo je prednizon/prednizolon, jer je manje toksičan u slučaju produžene upotrebe u poređenju sa nekim drugim preparatima.

Uobičajena intravenozna ruta je infuzija. Cilj je da se u nekoliko sati (2 do 6 sati) primi velika količina prednizona kako bi se postigao veoma značajan trenutni efekat smanjenja bola i protivupalni efekat (bez štetnih efekata ove vrste lečenja ako bi bio primenjen oralno u ekvivalentnoj dozi).

Infuzije se obično ponavljaju 3 dana zaredom. Ovaj terapeutski način se naziva "prednizonski napad" (ili "puls"). Efekat ove infuzije obično traje nekoliko nedelja.

Međutim, ovaj tip tretmana zahteva posebne mere opreza (pregledi pre infuzije, strogi odmor i praćenje tokom i nakon infuzije). To opravdava hospitalizaciju za njegovu primenu. Ređe, u lupusu, prednizon se može primeniti kao injekcija u zglob. Ovo je posebno moguće u velikim zglobovima kao što je koleno u slučaju ponovljenog izliva u zglob, što je retko.