DA, nekoliko autoimunih bolesti može biti povezano sa lupusom. Verovatno zajednička genetska osnova stoji iza ovih povezanosti. Sjogrenov sindrom (autoimuna bolest koja se uglavnom izražava suvim ustima i/ili očima) može biti povezan sa lupusom, u oko 20% slučajeva.

Sindrom antiphospholipidnih antitela, koji karakteriše stvaranje krvnih ugrušaka (tromboze) u arterijama ili venama i specifična antitela, često je povezan sa lupusom.

Ostale sistemske autoimune bolesti, kao što su inflamatorne miopatije ili sklerodermija, mogu biti povezane sa lupusom: ovo se naziva mešovita bolest vezivnog tkiva.

Na kraju, lupus može biti povezan sa "lokalizovanim" autoimunim bolestima, uključujući tiroiditis ili miasteniju gravis.