In vitro fertilisatie gaat vaak gepaard met hormonale behandelingen die lupus kunnen "activeren" en een tijdelijke versterking van de behandeling nodig kunnen maken. In het geval van hormoontherapie moet men bijzonder alert zijn op het risico op bloedstolsels (trombose) bij patiënten met APS. Het is van essentieel belang dat deze procedure wordt uitgevoerd met nauwgezette medische controles en speciaal aangepaste behandelingen.