Het houdt zelden rechtstreeks verband met de ziekteactiviteit. Toch klagen patiënten met lupus vaak over hoofdpijn. Meestal gaat het om zogenaamde "spanningshoofdpijn", veroorzaakt door stress en niet direct gerelateerd aan lupus (behalve dat stress gerelateerd kan zijn aan het hebben van een chronische ziekte).

Soms gaat het om migraine die eenzijdig is en soms wordt voorafgegaan door visuele stoornissen, of sinusitis die geen verband houdt met lupus. In zeldzame gevallen kan de hoofdpijn wijzen op een complicatie die specifiek verband houdt met lupus, zoals een beroerte of hoge bloeddruk. In deze gevallen reageert de hoofdpijn niet op de gebruikelijke behandelingen tegen pijn, houdt deze verscheidene dagen aan en gaat deze vaak gepaard met andere symptomen. Het is noodzakelijk om snel uw arts te raadplegen die, na een gedetailleerd klinisch onderzoek, zal beoordelen of aanvullend neurologisch onderzoek (CT-scan of MRI van de hersenen) nodig is.