Sí, varias enfermedades autoinmunes pueden estar asociadas con el lupus sistémico. Un terreno genético común es probablemente la causa de estas asociaciones.

No obstante, el síndrome de Sjögren, que se manifiesta principalmente por la sequedad de boca y/o ojos, y puede estar asociado al lupus en un 20% de los casos, suele ser menos grave e incapacitante que el síndrome de Sjögren aislado (también llamado primitivo). Asimismo, la presencia de anticuerpos antifosfolipídicos es un signo común del propio lupus. Cuando estos anticuerpos provocan la formación de coágulos de sangre (trombosis), se habla de síndrome antifosfolipídico, pero es una expresión clínica específica de la enfermedad. En cuanto al fenómeno de Raynaud, este es uno de los signos que se observan con frecuencia durante el lupus sistémico.

Más raramente, el lupus sistémico puede estar asociado a otra enfermedad autoinmune con expresión clínica como la artritis reumatoide, la esclerodermia o la miopatía inflamatoria. Esto se denomina síndrome de solapamiento (lupus sistémico + otra enfermedad del tejido conectivo).