Gubitak kose (medicinski termin "alopecija"), obično rasprostranjen po celomvlasištu, ponekad prati aktivnost lupusa. On nestaje bez posledica uz opšti tretman bolesti. Međutim, ponovni rast kose je spor... S druge strane, kada diskoidni lupus dovodi do lokalizovanih područja alopecije, postizanje ponovnog rasta kose je neizvesno. Ako do gubitka kose dođe van pogoršanja lupusa, treba tražiti drugi uzrok. To može biti sekundarno usled upotrebe lekova (imunosupresivi), deficita gvožđa ili vitamina, nepravilnosti u radu štitaste žlezde, viška testosterona (hiperandrogenizam), stresne situacije ili ponekad frizerskih navika (pletenje kose uz alopeciju zbog povlačenja).
Na kraju, povećan gubitak kose je čest kod svih žena u periodu nakon porođaja. Dakle, to nije sinonim za aktivnost lupusa tokom ovog perioda.
Sistemski lupus može biti praćen difuznim gubitkom kose koji se povlači kada se pogoršanje potpuno smiri. Ako do gubitka kose dođe van pogoršanja lupusa, onda treba tražiti drugi uzrok.