Существуют два вида протоколов исследований — фундаментальные и клинические, которые отличаются по своим целям. Фундаментальные исследования направлены на улучшение понимания патофизиологии заболевания, а клинические и терапевтические исследования - на оценку заболевания и проверку новых методов лечения и терапевтических стратегий в сравнении с уже существующими методами лечения или плацебо.

Перед включением пациента в исследование необходимо получить его согласие путем предоставления информационного документа и формы информированного согласия. Для реализации исследования нужно найти спонсора, получить одобрение консультативного комитета по защите лиц и финансирование для его организации и практической реализации.