Kilpirauhasen tulehdus voi johtaa sen tuhoutumiseen. Kilpirauhastulehdukseen johtavat mekanismit ovat useimmiten autoimmuuniperäisiä. Biologisesti (jos testejä tehdään) kilpirauhastulehdus aiheuttaa kilpirauhasen vasta-aineiden ilmaantumisen veriseerumiin (veren nestemäinen osa).