Antigeeni on mikä tahansa molekyyli, joka saa elimistössä aikaan immuunivasteen. Vasta-aine on tämän tietyn antigeenin vaikutuksesta syntyvä valkuaisaine, se on spesifinen juuri sille ja neutraloi antigeenin antigeenireseptorien kautta. Antigeenit ovat yleensä elimistölle vieraita aineita (joita sillä ei normaalisti ole) ja näitä ovat useimmiten bakteerit, virukset, loiset, sienet, myrkyt, rokotteet tai syöpäsolut.