Vypadávání vlasů (v lékařské terminologii "alopecie"), obvykle po celé pokožce hlavy, někdy doprovází aktivitu lupusu. Při celkové léčbě onemocnění regreduje bez následků. Odrůstání je však pomalé... Na druhé straně, pokud diskoidní lupus vede k lokalizovaným okrskům alopecie, je dosažení opětovného růstu nejisté. Pokud k vypadávání vlasů dochází mimo vzplanutí lupusu, je třeba pátrat po jiné příčině. Může se jednat o sekundární vliv léku (imunosupresivum), nedostatek železa nebo vitamínů, abnormality štítné žlázy, nadbytek testosteronu (hyperandrogenismus), stresovou situaci nebo někdy kadeřnické návyky (pletení vlasů při trakční alopecii).

V neposlední řadě je v období po porodu u všech žen běžné zvýšené vypadávání vlasů. Není tedy synonymem pro aktivitu lupusu v tomto období.