Evet, birçok otoimmün hastalık sistemik lupus ile ilişkili olabilir. Bu ilişkilerin nedeni muhtemelen ortak bir genetik zemindir.

Bununla birlikte esas olarak ağız ve/veya göz kuruluğu ile kendini gösteren Sjögren sendromu vakaların yaklaşık 'sinde lupus ile ilişkili olabiliyorsa genellikle sadece Sjögren sendromu olanlara göre daha az şiddetli ve daha az hasar bırakır. Benzer şekilde, antifosfolipid antikorlarının varlığı da lupusun yaygın bir belirtisidir. Bu antikorlar kan pıhtısı oluşumuna (tromboz) neden olduğunda, antifosfolipid sendromu olarak adlandırılır ancak bu hastalığın spesifik bir klinik ifadesidir. Raynaud fenomeni ise sistemik lupus sırasında sıklıkla gözlenen belirtilerden biridir.

Daha nadir olarak, sistemik lupus; romatoid artrit, skleroderma veya inflamatuar miyopati gibi klinik ifadesi olan başka bir otoimmün hastalıkla birlikte görülebilir. Buna overlap sendromu (Sistemik Lupus + başka bir bağ dokusu hastalığı) denir.