Hidroksiklorokin/klorokin iyi tolere edilen bir ilaçtır. Hidroksiklorokin, gözde yaptığı yan etkileri azaltmak için uzun bir tedavi süresi boyunca 5 mg/kg gerçek vücut ağırlığını aşmayan bir dozda önerilir. Lupus aktif olduğunda, normal ağırlığın 6,5 mg/kg'ını aşmayan daha yüksek bir doz gerekebilir (80 kg'dan ağır hastalar için, SLE'de maksimum günlük 400 mg doz önerilir).
Ürün özellikleri özetinde belirtilen alınmasınn skaıncalı oldugu durumlar arasında retina hastalığı öyküsü ve bu ilaç grubuna (sıtma ilaçları) karşı bilinen aşırı duyarlılık yer almaktadır.
Alerjik reaksiyon durumunda immunoloji biriminde yapılan duyarsızlaştırma etkili olabilir. Hidroksiklorokin emzirme döneminde herhangi bir endişe olmaksızın kullanılabilir. Hamilelik ve emzirmenin tedaviyi durdurmak için bir neden olmadığını unutmayın.
Retinopati (gözün arkasında görmeyi sağlayan zar olan retinada hasar) öyküsü yetişkin lupus hastaları için tek mutlak ilacı kesme nedeni olmaya devam etmektedir. Hidroksiklorokin/klorokin tedavisinin izlenmesi, potansiyel yan etkilerinin başlamasını önlemeyi amaçlamaktadır. En sorunlu yan etkisi retina üzerindeki potansiyel etkisidir (retinopati).
Bu komplikasyonun görülme sıklığı klinik uygulamada düşüktür. Hidroksiklorokin ile tedavi edilen romatizmal hastalığı olan birkaç bin kişide toksisiteye rastlanmamış veya çok az rastlanmıştır.
Hidroksiklorokinin göz doktoru tarafından izlemi için öneriler yandaki tabloda verilmiştir.

Hidroksiklorokinin diğer yan etkileri, genellikle geçici olan veya dozajın azaltılmasıyla ortadan kalkan sindirim bozukluklarıdır.
Beyaz kan hücrelerinde çok düşük bir azalma riski vardır, ancak kan sayımı yaparak bu yan etkinin takip edilmesi gerekir (çoğunlukla lupusun rutin takibinde bakılan değerlere bakılır).
Son olarak, kalp iletimi üzerinde herhangi bir etki olup olmadığını kontrol etmek için hidroksiklorokin almadan önce ve sonra elektrokardiyogram (EKG) yapılması tercih edilir, ancak bu risk istisnai bir durumdur.
Hidroksiklorokinin kan konsantrasyonunun belirlenmesi (hidroksiklorokinemi) yaygın uygulamada giderek daha fazla kullanılmaktadır. Kandan eliminasyonu çok uzun olduğu için hidroksiklorokinin olması gerektiği gibi alınıp alınmadığını bilinmesini mümkün kılar. Ayrıca hidroksiklorokin dozunun bireye uyarlanmasını da kolaylaştırır.
Hidroksiklorokin / klorokin genellikle iyi tolere edilen ilaçlardır ve erişkin lupus hastalarında tek mutlak kullanım engeli, daha önce retina hastalığı (retinopati) öyküsünün bulunmasıdır.
Bu nedenle düzenli göz (oftalmolojik) kontroller önerilir. Ayrıca vurgulamak gerekir ki gebelik, bu tedavinin kesilmesi için artık bir neden değildir.