Στις περισσότερες περιπτώσεις, οι πεπτικές διαταραχές δεν σχετίζονται με τον λύκο. Ο πεπτικός σωλήνας σπάνια επηρεάζεται κατά τη διάρκεια αυτής της νόσου. Οι πεπτικές διαταραχές σχετίζονται συχνότερα με φάρμακα, όπως η λήψη αντιφλεγμονωδών φαρμάκων, συνθετικών αντιελονοσιακών ή ανοσοκατασταλτικών. Μπορεί να υπάρχουν καούρες, ναυτία, κοιλιακό άλγος, κακή πέψη ή ακόμη και διάρροια. Ορισμένα συμπτώματα είναι προσωρινά, ιδίως αυτά που σχετίζονται με τη λήψη συνθετικών αντιελονοσοκομικών, τα οποία εξαφανίζονται αυθόρμητα μετά από μερικές εβδομάδες θεραπείας. Σε άλλες περιπτώσεις, η καούρα μπορεί να δικαιολογήσει μια γαστροδωδεκαδακτυλική ινοσκόπηση, για να διασφαλιστεί η απουσία φλεγμονής ή έλκους του βλεννογόνου. Το στρες, το άγχος, ο καπνός και το αλκοόλ αποτελούν επίσης συνήθεις αιτίες διαταραχών του πεπτικού συστήματος. Πιο σπάνια, μπορεί να εμφανιστεί αγγειακή συμμετοχή με φλεγμονή ή θρόμβωση των πεπτικών αγγείων. Οι ασθενείς τότε περιγράφουν "κράμπες" στην κοιλιά κατά τη διάρκεια της πέψης. Μπορεί επίσης να πρόκειται για λειτουργική κολοπάθεια ("ευερέθιστο έντερο"), όπως μπορεί να παρατηρηθεί στον γενικό πληθυσμό.