Главоболието рядко е пряко свързано с активността на заболяването. Въпреки това пациентите с лупус често се оплакват от главоболие. Най-често това са т.нар. "тензионни" главоболия, причинени от стрес, които не са пряко свързани с лупус (освен стресът, свързан с наличието на хронично заболяване).

Това могат да са едностранни мигрени, които понякога се предшестват от зрителни смущения, или синузит, несвързан с лупуса. В редки случаи главоболието може да е признак на усложнение, свързано конкретно с лупуса, като например инсулт или високо кръвно налягане. В тези случаи главоболието не се повлиява от (или е резистентно на) обичайно лечение на болката, продължава няколко дни и често е придружено от други симптоми. Необходимо е бързо да се консултирате с Вашия лекар, който след подробен клиничен преглед ще прецени необходимостта от провеждане на допълнителни неврологични изследвания (компютърна томография или ядрено-магнитен резонанс на мозъка).