MR, beyin, omurga, eklemler ve yumuşak dokular gibi birçok organı büyük bir hassasiyetle incelemek için manyetik enerjiyi kullanır. Çok ince bir analizin gerekli olduğu ve bazı lezyonların standart röntgen, ultrason veya tomografi taramalarında görünmediği durumlarda çok faydalıdır. Farklı düzlemlerde kesitsel görüntülerin elde edilmesini ve analiz edilen yapının üç boyutlu görülmesini sağlar.