Šalutiniai poveikiai susiję su vaisto savybėm ir jo sukauptu kiekiu organizme. Taip pat didesnė ar mažesnė tolerancija priklauso nuo individualių asmens savybių: kai kurie gerai toleruoja dideles dozes, o kitiems net ir mažos dozės sukelia šalutinį poveikį. Yra būdų kaip išvengti ar sumažinti šalutinius arba nepageidaujamus poveikius, ar sumažinti jų intensyvumą. Pagrindiniai šalutiniai reiškiniai: :

Veido tinimas, svorio didėjimas, ypač gydymo pradžioje ir vartojant dideles dozes: rekomenduojama vengti daug druskos, riboti cukrų (tiek mono-, tiek polisacharidus, kurių yra krakmolinguose maisto produktuose: makaronuose, duonoje, ryžiuose, bulvėse, manų kruopose...), neužkandžiauti tarp valgių ir nedidinti maisto porcijų. Jeigu visgi nepavyksta, svoris ir veido tinimas palaipsniui išnyks, kortizono dozėms mažėjant.

Aukštas kraujo spaudimas:rekomenduojama reguliariai tikrintis kraujospūdį, ypač esant inkstų pažeidimui.

Padidėjusi infekcijos rizika:rekomenduojama skiepytis laiku ir vengti kontakto su sergančiais asmenimis ūmiu infekcijos laikotarpiu.

Pacientams, kilusiems iš atogrąžų kraštų arba ilgą laiką praleidusiems šiuose kraštuose, pradėjus gydymą kortizonu, gali "pabusti" organizme esantys parazitai, tokie kaip, pavyzdžiui, anguililiozė. Galima profilaktika antiparazitiniais vaistais prieš pradedant gydymą kortizonu.

Cukrinio diabeto rizika:cukraus kiekio reguliacija kraujyje, ypač gydymo pradžioje.

Ilgalaikė kaulų retėjimo (osteoporozės) rizika: rekomenduojama reguliariai vartoti kalcį, vitaminą D, mankštintis. Esant indikacijoms- galima skirti kaulinio audinio atsinaujimą skatinančius vaistus, pavyzdžiui, bisfosfonatus (ypač po menopauzės).

Odos kraujagyslių trapumas, dėl kurio gali atsirasti mėlynių minimalių sužeidimų metu ir strijų.

Avaskulinė kaulo nekrozė, t. y. ilgųjų kaulų kraujotakos sutrikimas, kurį gali sukelti vilkligė, antifosfolipidiniai antikūnai ir/ar kortikosteroidai.

Tam tikrų raumenų atrofija: rekomenduojama reguliariai užsiimti jėgos ir kardio treniruotėmis.

Padidėjusi širdies - kraujagyslių ligų rizika ir aterosklerozė, ypač vartojant dideles / vidutines kortikosteroidų dozes (didesnes nei 5-7,5 mg/kg)

Kataraktos rizika: kataraktos ir glaukomos (padidėjusio akispūdžio) rizika: rekomenduojama kasmet atlikti akių apžiūrą, įskaitant akispūdžio matavimą. Ši rizika yra didesnė, kai kortizono skiriama ilgą laiką.

Priešingai nei manoma, kortikosteroidai nedaro žalingo poveikio skrandžiui (priešingai nei nesteroidiniai vaistai nuo skausmo ir uždegimo bei didelėmis dozėmis vartojamas aspirinas). Vis dėlto, kai kortikosteroidai vartojami kartu su nedidele aspirino doze, galima vartoti ir skrandį apsaugančius preparatus. Kortikosteroidai gali skatinti divertikulinio sigmoidito superinfekciją. Galiausiai reiktų pažymėti, kad staiga nutraukus gydymą kortikosteroidais kyla antinksčių nepakankamumo rizika, ypač jei šis gydymas buvo vartojamas ilgą laiką.