Galvos skausmas retai tiesiogiai susijęs su ligos aktyvumu. Nepaisant to, vilklige sergantys pacientai dažnai skundžiasi galvos skausmais. Dažniausiai tai būna vadinamieji "įtampos" galvos skausmai, kuriuos sukelia stresas ir kurie nėra tiesiogiai susiję su vilklige (išskyrus tai, kad lėtinė liga gali sukelti stresą).

Taip pat galvą skauda dėl vienpusės migrenos (prieš jai prasidedant kartais būna regos sutrikimų) arba dėl sinusito (šios priežastys nesusijusios su vilklige). Retais atvejais galvos skausmas yra sąlygotas vilkligės komplikacijų, pvz.: dėl insulto arba aukšto kraujo spaudimo. Tokiais atvejais galvos skausmai nepasiduoda (arba yra atsparūs) įprastiniam gydymui, tęsiasi kelias dienas ir dažnai būna lydimi kitų simptomų. Būtina skubiai kreiptis į gydytoją, kuris, atlikęs išsamią klinikinę apžiūrą, įvertins, ar reikia atlikti papildomus neurologinius tyrimus (kompiuterinę tomografiją arba galvos smegenų magnetinį rezonansą).