Магнитно-резонансната томография използва магнитната енергия на протоните, за да изследва с голяма прецизност много органи като мозъка, гръбначния стълб, ставите и меките тъкани. Тя е от голяма полза, когато е необходим много прецизен анализ и някои лезии не се виждат при стандартното рентгеново изследване, ултразвук или компютърна томография. ЯМР дава възможност за получаване на изображения на напречни сечения в различни равнини и за реконструиране в триизмерен образ на анализираната структура.