Malarialääkkeet ovat lääkkeitä, joita käytetään malarian parantavaan tai ehkäisevään hoitoon. Joillakin malarialääkkeillä on myös immunomoduloivia ominaisuuksia, joita käytetään autoimmuunisairauksien hoidossa. Systeemisessä lupuksessa käytetään kahta pääasiallista lääkettä: hydroksiklorokiinia ja klorokiinia. Klorokiinia ei ole saatavilla Suomessa.