Lihaskipua esiintyy myös erilaisissa akuuteissa tai kroonisissa sairauksissa, jotka ovat mekaanisia, tulehduksellisia, kemiallisia, tarttuvia tai autoimmuunisairauksia. Hoitona on taustalla olevan sairauden hoito. Lisäksi kivun lievittämiseksi käytetään paikallisia tai yleisiä kipulääkkeitä ja relaksantteja.