Ja, verschillende auto-immuunziekten kunnen samen voorkomen met systemische lupus. Een gemeenschappelijke genetische achtergrond is waarschijnlijk de oorzaak van deze associaties.

Niettemin, als het syndroom van Sjögren, dat vooral gekenmerkt wordt door een droge mond en/of droge ogen, in ongeveer 20% van de gevallen met lupus kan worden geassocieerd, is het vaak minder ernstig en minder invaliderend dan het geïsoleerde syndroom van Sjögren (ook primair genoemd). Ook de aanwezigheid van antifosfolipide antilichamen is een veel voorkomend teken van lupus zelf. Wanneer deze antilichamen de vorming van bloedstolsels (trombose) veroorzaken, spreekt men van het antifosfolipidensyndroom, maar dat is een specifieke klinische uiting van de ziekte. Het fenomeen van Raynaud is een van de tekenen die vaak worden waargenomen bij systemische lupus.

In zeldzame gevallen kan systemische lupus gepaard gaan met een andere auto-immuunziekte, zoals reumatoïde artritis, sclerodermie of inflammatoire myopathie. Dit wordt een overlapsyndroom genoemd (systemische lupus + een andere bindweefselziekte).